棉田如果覆蓋過地膜，那樣肥料的施加就應該注意施加化肥的用量。地膜棉田的棉株，由于地膜增溫保墑的作用，生長發育快，株高葉多，生長期延長，產量比露地棉有較大幅度增長。因此必須注意培肥地力，增施優質的農家肥，科學施用化肥。
在給地膜棉田施用化肥時，原則上是施用農家肥為主，化肥為輔，注意氮磷鉀肥的合理配合，做到以產定肥。如要達到畝產皮棉75-100公斤，基肥應該施用4000-5000公斤優質農家肥，磷肥40-50公斤，氮肥7.5-10公斤或磷酸二銨25-30公斤，有條件可增施餅肥20-25公斤。除氮肥外，其它化肥應在秋翻前采取全面撒施方式施用翻入土中，也可在早春結合整地施入。餅肥事先應發酵好才能施用，至于化肥可將總施量的三分之一在早春整地時或播種前進行溝施。